История этого пожарно-спасательного подразделения неразрывно связана с Кирово-Чепецким химическим комбинатом. В 1946 году было принято постановление о включении комбината в программу создания советской атомной бомбы, а именно в решение задачи промышленного производства гексафторида урана.
Это событие поспособствовало изданию приказа ГУПО МВД СССР, на основании которого 20 ноября 1948 года объявлен временный штат пятой отдельной военизированной пожарной команды (ОВПК-5) ОПО УМВД по охране завода № 752 (так в 1948 году именовался Кирово-Чепецкий химический комбинат) Министерства химической промышленности СССР. Этот день и считается датой образования ФГКУ «Специальное управление ФПС № 16 МЧС России».
Основная задача подразделений спецуправления — профилактика и тушение пожаров, проведение аварийно-спасательных работ в закрытом административно-территориальном образовании, особо важных и режимных организациях, расположенных на территории Кировской области. История Специального управления ФПС № 16 МЧС России неразрывно связана со строительством уникальных объектов Кирово-Чепецкого химического комбината.