Указом Президента Российской Федерации от 8 мая 1993 года № 643 «О гражданской обороне» общее руководство гражданской обороной в России было возложено на Председателя Правительства РФ, то есть по должности начальником Гражданской обороны РФ стал премьер-министр. Указом была подтверждена правопреемственность нормативной базы СССР в этой области, восстановлен институт начальников гражданской обороны, подтверждены персональная ответственность руководителей всех уровней за состояние гражданской обороны и их обязанности в этой сфере.
Курсы гражданской обороны были преобразованы в учебно-методические центры, а штабы гражданской обороны получили новое название – штабы по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям. Под руководством председателя ГКЧС России впервые был подготовлен и Президентом России 5 августа 1993 года утвержден новый План гражданской обороны Российской Федерации.