17 и 18 мая 2001 года в городе Ленске в результате небывалых по величине ледовых заторов на реке Лена произошло наводнение. В зону чрезвычайной ситуации попали г. Ленск, п.п. Батамай, Салдыкель, Южная Нюя, Н атора, Турукта Ленского улуса. Численность населения, подвергнувшаяся затоплению, составила 30,8 тыс. человек. Погибли 6 человек. Было разрушено более 3300 домов. Требуют восстановления 75 котельных, 396 км линий электропередач, 164 трансформаторных подстанций, дорог 184 км, мосты – 2 шт., 410 км линий связи, 5 радиотелепередающих станций, 7 объектов здравоохранения, 26 общеобразовательных учреждений. Суммарный ущерб от стихийного бедствия составил около 6 миллиардов рублей.
Еще в марте 2001 года специалистами Дальневосточного регионального центра по делам ГОиЧС было отмечено, что паводковая обстановка на р. Лена и ее крупных притоках в республике будет очень сложной.
13 мая 2001 г. в 23:30 часов в районе г. Ленска начался ледоход, который остановился через 1 час и возобновился в 13.30 часам 14 мая 2001 г.
К 14:00 часам уровень воды вырос на 292 см и составил 987 см. Через 3 часа уровень достиг отметки 1289 см (критический – 1380 см). В 19:50 часов - начальником ГО Ленского улуса был введен режим чрезвычайной ситуации. Оповещение населения было проведено по местному телевидению и радио, а также силами 12 СГУ УОВД.
В течение полутора часов силы и средства РСЧС г. Ленск были приведены в высшую степень готовности, развернуты 14 эвакопунктов, продолжались начатые ранее работы по укреплению насыпной дамбы. В зону бедствия прибыли спасатели «Центроспаса», Центра «Лидер», медики ВЦМК «Защита» и техника. Спасатели трудились круглосуточно.
16 мая 2001 г. в район бедствия прибыл глава МЧС России. К 10:45 часам уровень воды в реке Лена составил 1740 см, что превысило критический уровень на 390 см. Принято решение о проведении взрывных работ в районе о. Батамайский в месте образования затора протяженностью 80 км. После проведения взрывных работ уровень воды снизился до 1300 см. В г. Ленске начались восстановительные работы: в аэропорт г. Ленск доставлены 1500 т топлива из запасов «Госрезерва», восстановлены система водоснабжения и по временной схеме система энергоснабжения. Проводились мероприятия по обследованию подвальных помещений, откачке воды, подготовке к запуску хлебозавода, восстановлению системы канализации и очистных сооружений.
Одновременно с попытками разрушения затора проводились мероприятия по эвакуации и первичному жизнеобеспечению населения. Была организована доставка питьевой воды, хлеба, медикаментов в эвакопункты и пункты временного пребывания. Организовано оказание экстренной медицинской помощи.
В спасательных работах было задействовано от РСЧС 17 воздушных судов, 27 лодок, 54 спасателя (от МЧС России - 9 лодок, 3 вертолета и 31 спасатель). Существовала острая нехватка лодок 18 мая 2001 года было принято решение эвакуировать людей, оказавшихся на открытых незатопленных площадках, за город, в здание аэропорта и расположенную севернее города гору Шаман, где развернут палаточный лагерь.
Из г. Мирный в район г. Ленск (эвакопункт на горе Шаман, протяженность маршрута 231 км.) для перевозки эвакуированных вышло 3 колонны автобусов: колонна №1 ( 13 автобусов - 400 мест), колонна №2 ( 20 автобусов - 500 мест), колонна №3 (20 автобусов - 360 мест). Дополнительно организован воздушный мост - аэропорт Ленск - г. Мирный. Вертолетчики МЧС России провели операцию по эвакуации 277 нетранспортабельных больных из ЦРБ г. Ленска в г. Мирный. Самолетами АН-24, АН-74 пациентов доставляли в медицинские центры. Самолетами Ил-76 доставляли строительные материалы, технику, оборудование, жизненно важные гуманитарные грузы (продовольствие, одежду, медикаменты и т.д.). Из различных регионов страны самолеты доставляли строительные бригады. На вертолетах к местам ледяных заторов на реке доставлялись саперы с взрывчаткой.
Таким образом с 5.00 до 17.00 часов 18 мая 2001 года эвакуировано свыше 1700 человек, а с начала работ в эвакопункты всего доставлено 7 800 человек. Эвакуация людей проводилась на пункты приема, расположенные в городе Мирный (Школа-интернат, средние школы №№ 1,2,7,8,12,26,27, девять детских садов, ДЮСШ, центральная больница, колледж) и в населенные пункты Светлый, Алмазный, Арылах и Зоря.
Наводнение в г. Ленск вошло в историю чрезвычайного ведомства как пример мужества, самоотверженности и стойкости специалистов МЧС России, команд, проводивших взрывные работы в местах заторов. Ежеминутно рискуя жизнью они разрушали лед в голове заторов. В результате этого г. Ленск и другие населенные пункты находились в затопленном состоянии непродолжительное время, что значительно снизило риск жизни людей и материальных потерь. Умело организованная эвакуация позволила максимально уменьшить количество жертв со стороны населения.